2003年10月,市政府确定了轨道交通线网14条线路,3条城际铁路和1条市郊列车线规划。分期分批实施。上述线路建成后，广州市轨道交通日客量将达到900万人次。线网密度：内环路以内1.27公里/平方公里，环城高速公路以内0.77公里/平方公里，都会区以内0.22公里/平方公里。到2010年，广州市将有9条轨道交通线建成，届时，地铁线网长度达到200公里，形成以城市快速轨道交通为骨干的多层次、多功能、多类型的城市综合交通体系。

　　广州地铁一号线于1993年12月28日正式动工，1997年6月28日起开始试运营，首段开通西朗至黄沙段，全线于1998年12月28日竣工，到1999年6月28日才正式通车，标志著中国大陆继北京、天津及上海后，第4座城市建有地铁系统，同时标志着广州交通迈入地铁时代。 广州地铁一号线全线设有16个车站，线路全长约18.48公里。

　　广州地铁二号线首通段(三元里─晓港)于2002年12月29日开始运营。2003年6月28日地铁二号线（三元里─琶洲段）开始试营运。

　　2005年12月26日，广州地铁三号线海珠区客村站至天河区火车东站，四号线万胜围站（连接二号线琶洲站）至新造站（大学城专线）建成通车。

　　2006年12月30日，广州地铁三号线火车东站至番禺广场、支线体育西站至天河客运站建成通车，四号线开通万胜围站至黄阁站。三号线全线长36.33公里，相当于一二号线的总和，被地铁建设者们称为“地下长城”。四号线二期长27.1公里，因为是广州首条高架地铁线路，也被称为广州地铁的“空中飞龙”。

　　建设中的地铁五号线贯通广州市旧城中心区和珠江新城中央商务区，联结西部发展区和东部转移带的东西向轨道交通骨干线，为贯彻广州市“南拓、北优、东进、西联”发展战略中的“东进、西联”方针起到重要作用。